Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9Q3V038 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms