Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hipk4Q3V016 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms