Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms