Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B230104I21RikQ3USW4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B230104I21RikQ3USW4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B230104I21RikQ3USW4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B230104I21RikQ3USW4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B230104I21RikQ3USW4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B230104I21RikQ3USW4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B230104I21RikQ3USW4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B230104I21RikQ3USW4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B230104I21RikQ3USW4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms