Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec31aQ3UPL0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms