Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3UPC7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q3UPC7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3UPC7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3UPC7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3UPC7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms