Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smu1Q3UKJ7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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