Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Zyg11bQ3UFS0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zyg11bQ3UFS0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms