Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atxn7l3bQ3UD01 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms