Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms