Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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