Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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