Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms