Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd4Q3TT99 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd4Q3TT99 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms