Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms