Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdnep1Q3TP92 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms