Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc10Q3TLI0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms