Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2f1Q3THK3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms