Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hdgfl1Q2VPR5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hdgfl1Q2VPR5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hdgfl1Q2VPR5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hdgfl1Q2VPR5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hdgfl1Q2VPR5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hdgfl1Q2VPR5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hdgfl1Q2VPR5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl1Q2VPR5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl1Q2VPR5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl1Q2VPR5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl1Q2VPR5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl1Q2VPR5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms