Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim71Q1PSW8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim71Q1PSW8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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