Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sap25Q1EHW4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sap25Q1EHW4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sap25Q1EHW4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sap25Q1EHW4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap25Q1EHW4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms