Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myo3bQ1EG27 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo3bQ1EG27 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms