Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ptchd1Q14B62 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ptchd1Q14B62 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ptchd1Q14B62 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ptchd1Q14B62 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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ptchd1Q14B62 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ptchd1Q14B62 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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ptchd1Q14B62 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ptchd1Q14B62 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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