Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gli2Q0VGT2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms