Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc162pQ0VG85 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms