Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp2b3Q0VF55 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms