Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc1Q0VDN7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms