Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83bQ0VBM2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Fam83bQ0VBM2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam83bQ0VBM2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam83bQ0VBM2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam83bQ0VBM2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam83bQ0VBM2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam83bQ0VBM2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms