Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms