Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms