Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms