Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnn1Q08091 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnn1Q08091 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnn1Q08091 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnn1Q08091 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnn1Q08091 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnn1Q08091 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnn1Q08091 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnn1Q08091 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnn1Q08091 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnn1Q08091 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnn1Q08091 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms