Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms