Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms