Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox4Q06831 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms