Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp2Q06649 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms