Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr16c6Q05A13 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms