Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms