Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmn1Q05860 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms