Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcn1Q05186 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms