Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms