Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr5Q04683 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr5Q04683 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms