Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna1sQ02789 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna1sQ02789 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna1sQ02789 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna1sQ02789 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna1sQ02789 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna1sQ02789 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna1sQ02789 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna1sQ02789 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna1sQ02789 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna1sQ02789 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms