Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms