Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pax5Q02650 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax5Q02650 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax5Q02650 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax5Q02650 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax5Q02650 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax5Q02650 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax5Q02650 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax5Q02650 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax5Q02650 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax5Q02650 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax5Q02650 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax5Q02650 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax5Q02650 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax5Q02650 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax5Q02650 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax5Q02650 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pax5Q02650 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms