Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ascl1Q02067 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms