Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RykQ01887 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RykQ01887 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RykQ01887 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RykQ01887 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RykQ01887 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RykQ01887 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RykQ01887 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RykQ01887 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RykQ01887 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RykQ01887 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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