Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbp1Q01514 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms