Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms