Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde1bQ01065 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms